Проверьте, чтобы в этих закладках стояли галочки:
- Учет отсутствий — в полях Командировка и Отгулы.
- Прочие начисления — в поле Работа в праздничные и выходные дни.
Если флажков нет, поставьте их, кликнув на нужное поле, и сохраните настройки.
После этого переходите к оформлению командировки.